转会深圳平安是郑智职业生涯非常重要的一步，来到深圳后的郑智在恩师朱广沪的调教下迅速成为球队进攻组织的灵魂，并且逐渐显现住领袖的气质。2002年在深圳平安的第二个赛季郑智不仅仅在球队继续发挥领袖的作用，深圳队的战绩也是直线上升，最终在当年深圳队憾居第二，郑智的表现却得到了球迷的认可，郑智也凭借这一年的表现荣膺中国足球先生。2004年，中超元年，郑智率领的深圳健力宝力压山东鲁能获得冠军，也使得深圳队和郑智达到了职业生涯的最巅峰。2005年，获得了首座联赛冠军奖杯的郑智选择加盟山东鲁能，不过由于与新教练和新球队的磨合，刚到山东的郑智并没有立即成为球队的核心。2006年实力强大的山东队终于创记录提前6轮获得了中超联赛冠军，郑智作为球队的核心也成为了目前中国足坛领军人物。